Julia Lipowicz

Biologia molekularna · Biotechnologia medyczna · Bioinformatyka

Cześć, jestem Julia Lipowicz

mgr biotechnologii medycznej · doktorantka · kierowniczka grantu NCN Preludium

Moje doświadczenie obejmuje lata pracy w środowisku naukowo-medycznym i akademickim, ze szczególnym uwzględnieniem pracy laboratoryjnej w zakresie biologii molekularnej, mikrobiologii i inżynierii genetycznej. Posiadam liczne kompetencje obejmujące biotechnologię, bioinformatykę, publikowanie naukowe, pedagogikę na poziomie akademickim oraz zarządzanie grantami naukowymi.

Zobacz publikacje Skontaktuj się
  • 7+publikacji naukowych
  • 2granty naukowe
  • C2język angielski
Julia Lipowicz w fartuchu laboratoryjnym w pracowni biologii molekularnej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
O mnie

Naukowczyni z pasją do molekularnych zagadek raka

Moje doświadczenie obejmuje lata pracy w środowisku naukowo-medycznym i akademickim, ze szczególnym uwzględnieniem pracy laboratoryjnej w zakresie biologii molekularnej, mikrobiologii i inżynierii genetycznej.

Posiadam liczne kompetencje obejmujące biotechnologię, bioinformatykę, publikowanie naukowe, pedagogikę na poziomie akademickim oraz zarządzanie grantami naukowymi. Pracuję zarówno przy stanowisku laboratoryjnym, jak i w analizie danych transkryptomicznych z baz TCGA, GEO czy cBioPortal.

Specjalizuję się w biologii molekularnej nowotworów – w szczególności w mechanizmach lekooporności, epigenetyce oraz inżynierii genetycznej. Prowadzę hodowle 2D i 3D, eksperymenty z cytometrią przepływową, chromatografią, qPCR, Western blot, mikroskopią fluorescencyjną i systemem CRISPR/Cas9.

Doświadczenie

Ścieżka naukowa i zawodowa

  1. 10/2022 – teraz

    Doktorantka, Szkoła Doktorska

    Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu, Polska

    Praca naukowa i dydaktyczna w środowisku medycznym, z naciskiem na rozwój kompetencji laboratoryjnych oraz pracy ze studentami. Prowadzę pracę laboratoryjną obejmującą biologię molekularną nowotworów, hodowlę komórkową i mikrobiologiczną oraz analizy związane z inżynierią genetyczną.

  2. 02/2025 – teraz

    Kierowniczka grantu NCN Preludium 23

    Narodowe Centrum Nauki · Uniwersytet Medyczny w Poznaniu

    Kierowanie projektem badawczym „ERβ-zależna autofagia w raku jelita grubego i jej wpływ na proces nowotworzenia” (wartość: 209 860 zł). Planowanie i przeprowadzanie eksperymentów, zarządzanie budżetem i zespołem, pisanie raportów wynikowych oraz publikowanie manuskryptów w języku angielskim.

  3. 03/2023 – 05/2025

    Kierowniczka Dużego Grantu Badawczego Szkoły Doktorskiej

    Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu

    Odpowiedzialność za zaplanowanie i przeprowadzenie analiz oraz publikację wyników poprzez wystąpienia na konferencjach i publikacje naukowe.

  4. 04/2023 – 05/2023

    Staż naukowy STER-NAWA

    Uniwersytet w Stuttgarcie, Niemcy · Katedra Biochemii Molekularnej

    Praca z wykorzystaniem mikroskopii elektronowej, cytometrii przepływowej oraz systemu CRISPR/Cas9.

Publikacje

Publikacje naukowe

Wybrane prace w czasopismach indeksowanych w Web of Science. Pełna lista dostępna w profilu Web of Science.

  • 01
    Pierwsza autorka

    Genes co-expressed with ESR2 influence clinical outcomes in cancer patients: TCGA data analysis

    Lipowicz J.M., Malińska A., Nowicki M., Rawłuszko-Wieczorek A.A.

    International Journal of Molecular Sciences · MDPI · 2024

    Streszczenie

    ERβ has been assigned a tumor-suppressor role in many cancers, yet tissue-specific expression and function remain elusive. We present a comprehensive transcriptomic analysis of ESR2 across diverse tumor types using TCGA data. We identified cancer types with significant ESR2 expression changes and their impact on patient survival. GSEA distinguished molecular pathways affected by ESR2, including oxidative phosphorylation and EMT. We identified co-expressed genes with potential synergistic effects on clinical outcomes, including ACIN1, SYNE2, TNFRSF13C and MDM4.

  • 02

    Estrogen receptor β affects hypoxia response in colorectal cancer cells

    Rawłuszko-Wieczorek A., Lipowicz J., Nowacka M., Ostrowska K., Pietras P., Blatkiewicz M., Ruciński M., Jagodziński P.P., Nowicki M.

    BBA – Molecular Basis of Disease · Elsevier · 2023

    Streszczenie

    CRC occurrence inversely correlates with ERβ presence; low ERβ associates with worse OS. Our high-throughput study suggests ERβ represses hypoxic response in CRC cells. We observed altered transcriptional profiles in HCT116 ERβ-overexpressing cells, further stimulated by E2 under hypoxia. Downregulation of VEGFA, PDGFA and ANGPTL4 was validated in DLD-1 cells. Using a DNA-binding mutant we showed direct binding is required. ERβ may also affect HIF1A at transcriptional and translational levels.

  • 03

    It runs in the bromodomain family: speckled proteins (SP) play a role in the antitumor immune response in solid tumors

    Rosochowicz M.A., Lipowicz J.M., Karwacka M.I., Ostapowicz J., Cisek M., Mackiewicz A.A., Czerwińska P.

    International Journal of Molecular Sciences · MDPI · 2023

    Streszczenie

    Using TCGA transcriptomic data and immunological evidence from ESTIMATE, TIP and TIMER2.0 across solid tumors with tools such as GSEA and GSCA we demonstrate mechanisms and interactions between bromodomain proteins (BrD) of the SP family and immune infiltrates. SP-family genes positively correlate with immune score regardless of tumor type, with T-cell trafficking and infiltration, and with inflammatory response and TNF-α/NF-κB signalling – making them good predictors of high-immune-infiltration phenotypes.

  • 04

    The association between bromodomain proteins and cancer stemness in different solid tumor types

    Czerwińska P., Jaworska A.M., Włodarczyk N.A., Cisek M., Karwacka M., Lipowicz J., Ostapowicz J., Rosochowicz M., Mackiewicz A.A.

    International Journal of Cancer · Wiley · 2022

    Streszczenie

    Cancer stemness is essential for tumor development, progression and relapse. We harnessed TCGA and GEO data with Oncomine, PrognoScan, GEPIA2, TIMER2.0, TISIDB, GSEA and R2 to characterise BrD family expression vs. cancer stemness. Upregulation of ATAD2 and SMARCA4, and downregulation of SMARCA2, are consistently associated with stem-cell-like phenotype across 27 tumor types. ATAD2HIGH tumors are enriched with stem-cell markers and c-Myc targets – we propose ATAD2 as a novel druggable target for de-differentiated tumors.

  • 05

    Elacridar inhibits BCRP protein activity in 2D and 3D cell culture models of ovarian cancer and Re-Sensitizes cells to cytotoxic drugs

    Stasiak P., Sopel J., Płóciennik A., Musielak O., Lipowicz J.M., Rawłuszko-Wieczorek A.A., Sterzyńska K., Korbecki J., Januchowski R.

    International Journal of Molecular Sciences · MDPI · 2025

    Streszczenie

    Chemotherapy resistance is a major obstacle in the treatment of ovarian cancer, often resulting in disease recurrence and poor prognosis. A key contributor is the overexpression of ABC transporters, including BCRP/ABCG2. This study investigated elacridar (GG918), a dual P-gp and BCRP inhibitor, in TOP-sensitive and TOP-resistant ovarian cancer cells grown in 2D monolayers and 3D spheroid models. ABCG2 expression was quantified via qPCR; BCRP protein levels by western blot and immunofluorescence; drug response by MTT; transporter activity by flow cytometry and microscopic assessment of Hoechst 33342 and MIT retention. Elacridar effectively inhibited BCRP function and significantly enhanced sensitivity to TOP in both 2D and 3D cultures.

  • 06

    Elacridar reverses P-gp-mediated drug resistance in ovarian cancer cells in 2D and 3D culture models

    Stasiak P., Sopel J., Lipowicz J.M., Rawłuszko-Wieczorek A.A., Sterzyńska K., Korbecki J., Januchowski R.

    International Journal of Molecular Sciences · MDPI · 2025

    Streszczenie

    Multidrug resistance (MDR) remains a major obstacle in ovarian cancer treatment. We evaluated elacridar, a dual P-gp/BCRP inhibitor, in W1 cells (PAC-sensitive) and PAC-resistant variants in 2D and 3D conditions. MDR1 gene and P-gp expression were determined; P-gp activity by flow cytometry and fluorescence; viability by MTT. Elacridar effectively inhibited transporter activity and increased sensitivity to PAC and DOX, although re-sensitization in 3D was less pronounced. Findings highlight elacridar as a promising compound for reversing MDR.

  • 07

    The RNA world: from experimental laboratory to "in silico" approach. Part 1: user friendly RNA expression databases portals

    Kolenda T., Śmiełowska M.I., Lipowicz J., Ostapowicz J., Pacześna P., Rosochowicz M., Poter P., Kozłowska-Masłoń J., Guglas K., Dudek K., Grzejda N., Regulska K., Florczak A., Kazimierczak U., Lamperska K., Teresiak A.

    Reports of Practical Oncology and Radiotherapy · 2024

    Streszczenie

    Cellular information is stored, transferred and modified using different RNA molecules. Microarray chips and NGS, combined with bioinformatics, led to discovery of many ncRNAs. The Human Genome Project and TCGA contributed to formation of data storage and analysis portals widely used in cancer research. We discuss cBioPortal, UALCAN, ENCORI and others, focusing on data integration, simplicity of analysis and visualisation – important for users without bioinformatic or statistical skills.

Kompetencje

Umiejętności, wykształcenie, certyfikaty

Umiejętności kluczowe

  • Biotechnologia
  • Praca laboratoryjna
  • Bioinformatyka
  • Analiza statystyczna
  • Inżynieria genetyczna
  • Pisanie manuskryptów
  • Recenzja naukowa
  • Nauczanie akademickie
  • CRISPR/Cas9
  • qPCR · Western blot
  • Cytometria przepływowa
  • Hodowla komórkowa 2D/3D
  • TCGA · GEO · cBioPortal
  • R · GSEA
  • ÄKTA / FPLC

Umiejętności miękkie

  • Zarządzanie zespołem badawczym
  • Zarządzanie projektami
  • Zarządzanie grantami i budżetem
  • Przywództwo
  • Komunikacja naukowa
  • Wystąpienia konferencyjne
  • Mentoring studentów
  • Praca w zespole międzynarodowym
  • Krytyczne myślenie
  • Organizacja pracy
  • Zarządzanie czasem
  • Rozwiązywanie problemów
  • Prawo jazdy kategorii B

Wykształcenie

  • 11/2022 – teraz Szkoła Doktorska Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu
  • 10/2017 – 06/2022 Magister Biotechnologii Medycznej Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu

Języki

  • Polski ojczysty
  • Angielski C2

Certyfikaty

  • Data Visualization for Genome Biology · University of Toronto, 2024
  • The Data Scientist's Toolbox · Johns Hopkins University, 2026
  • R programming · Johns Hopkins University, 2026
  • Content Creation and Copywriting · Coursera, 2026
  • Good with Words: Writing and Editing · University of Michigan, 2026
  • Introduction to Generative AI · MIT, 2025
  • Google AI Professional Certificate · Google, 2026
  • Introduction to Artificial Intelligence · IBM, 2026
  • Focus on Peer Review · Nature Masterclasses, 2025
  • Chromatin Workshop: Tagmentation, ChIP, RNA-seq, Bioinformatics · Hologic Diagenode, 2025
  • UNICORN software for chromatography · Cytiva, 2024
  • ÄKTA chromatography systems · Cytiva, 2024

Członkini Ogólnopolskiego Stowarzyszenia Biotechnologów Medycznych.

Media i wyróżnienia

O mnie w mediach

Publikacje prasowe, profile naukowe i informacje o sprzęcie pod jej opieką.

Opiekun aparatury

ÄKTA Pure System — FPLC

Szybka chromatografia cieczowa białek (FPLC) w Centrum Medycyny Doświadczalnej UMP. Mgr Julia Lipowicz jest opiekunką sprzętu — jako jedyna osoba decyduje o jego użyciu i odpowiada za szkolenia użytkowników.

Centrum Medycyny Doświadczalnej UMP →

Prasa

Grant NCN Preludium 23

„Dziewięcioro doktorantów UMP rozbiło bank w Preludium 23” — projekt mgr Julii Lipowicz „ERβ-zależna autofagia w raku jelita grubego i jej wpływ na proces nowotworzenia” otrzymał finansowanie 209 860 zł.

rynekzdrowia.pl →

UMP

Nauka jest kobietą!

Cykl Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu, w którym przedstawiane są kobiety nauki UMP — m.in. mgr Julia Lipowicz.

ump.edu.pl →

Wyróżnienie

Szkoła Doktorska UMP

Wśród wybitnych osiągnięć doktorantów UMP — nagroda i wyróżnienie za wyniki naukowe oraz publikacje pierwszoautorskie.

doctoralschool.ump.edu.pl →

Profil

ResearchGate

Profil naukowy z publikacjami, cytowaniami i projektami badawczymi.

researchgate.net →

Profil

MOST Wiedzy

Otwarta polska platforma nauki — profil dorobku naukowego mgr Julii Lipowicz.

mostwiedzy.pl →

Zespół

Katedra i Zakład Histologii i Embriologii UMP

Macierzysty zespół badawczy — projekty z zakresu biologii molekularnej nowotworów, autofagii i receptora estrogenowego ERβ.

histologia.ump.edu.pl →

Kontakt

Porozmawiajmy o nauce i współpracy

Otwarta na propozycje pracy, współpracy badawczej, recenzji oraz zaproszenia na konferencje.

  • E-mail
  • Telefon
  • LinkedIn julialipowicz
  • Web of Science KPY-3497-2024

Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celu prowadzenia rekrutacji na aplikowane przeze mnie stanowisko oraz przyszłych procesów rekrutacyjnych.

Julia Lipowicz – kompletne podsumowanie / complete profile summary

Profil zawodowy (PL)

Mgr Julia Lipowicz (Julia Maria Lipowicz, cyt. Lipowicz J.M.) — biolog molekularny, magister biotechnologii medycznej (Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu, 2017–2022) i doktorantka Szkoły Doktorskiej UMP (od listopada 2022). Kierowniczka grantu Narodowego Centrum Nauki Preludium 23 „ERβ-zależna autofagia w raku jelita grubego i jej wpływ na proces nowotworzenia" o wartości 209 860 zł (luty 2025 – obecnie). Kierowniczka Dużego Grantu Badawczego Szkoły Doktorskiej UMP (marzec 2023 – maj 2025). Stażystka STER-NAWA na Uniwersytecie w Stuttgarcie, Katedra Biochemii Molekularnej (kwiecień–maj 2023, CRISPR/Cas9, cytometria przepływowa, mikroskopia elektronowa). Opiekun systemu ÄKTA Pure (FPLC) w Centrum Medycyny Doświadczalnej UMP. Członkini Ogólnopolskiego Stowarzyszenia Biotechnologów Medycznych.

Professional profile (EN)

Julia Lipowicz, MSc (Julia Maria Lipowicz, cited as Lipowicz J.M.) is a molecular biologist, Medical Biotechnology MSc graduate (Poznan University of Medical Sciences, 2017–2022) and PhD candidate at the PUMS Doctoral School (since November 2022). Principal Investigator of the Polish National Science Centre (NCN) Preludium 23 grant "ERβ-dependent autophagy in colorectal cancer and its impact on tumorigenesis", value PLN 209,860 (February 2025 – present). Manager of the Doctoral School's Large Research Grant (March 2023 – May 2025). STER-NAWA research fellow at the University of Stuttgart, Department of Molecular Biochemistry (April–May 2023, CRISPR/Cas9, flow cytometry, electron microscopy). Equipment custodian of the ÄKTA Pure (FPLC) system at the Centre for Experimental Medicine, PUMS. Member of The Polish Medical Biotechnologists Association.

Research expertise / Specjalizacja

Molecular biology of cancer / biologia molekularna nowotworów; multidrug resistance and ABC transporters (P-glycoprotein/MDR1, BCRP/ABCG2); estrogen receptor beta (ERβ, ESR2) signalling; bromodomain proteins family (ATAD2, SMARCA4, SMARCA2, SP family); autophagy in colorectal cancer; ovarian cancer chemoresistance; hypoxia response (HIF1A, VEGFA, PDGFA, ANGPTL4); epigenetics; CRISPR/Cas9 genetic engineering; 2D and 3D cell culture including spheroid models; qPCR, RT-PCR, Western blot, immunofluorescence, fluorescence and electron microscopy; flow cytometry; MTT viability assays; ÄKTA/FPLC protein chromatography; transcriptomic data mining using TCGA, GEO, cBioPortal, UALCAN, ENCORI, GSCA, TIMER2.0, ESTIMATE; statistical analysis in R; GSEA pathway enrichment.

Languages / Języki

Polski – ojczysty / Polish – native. Angielski C2 / English C2 (all scientific publications in English; international research collaboration at the University of Stuttgart).

Education / Wykształcenie

Publications (7) — Web of Science indexed

  1. Julia Lipowicz — first author — Genes co-expressed with ESR2 influence clinical outcomes in cancer patients: TCGA data analysis. International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2024. https://www.mdpi.com/1422-0067/25/16/8707
  2. Julia Lipowicz — co-author — Estrogen receptor β affects hypoxia response in colorectal cancer cells. BBA – Molecular Basis of Disease, Elsevier, 2023. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0925443923002600
  3. Julia Lipowicz — co-author — It runs in the bromodomain family: speckled proteins (SP) play a role in the antitumor immune response in solid tumors. International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2023. https://www.mdpi.com/1422-0067/24/1/549
  4. Julia Lipowicz — co-author — The association between bromodomain proteins and cancer stemness in different solid tumor types. International Journal of Cancer, Wiley, 2022. DOI: 10.1002/ijc.33937. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ijc.33937
  5. Julia Lipowicz — co-author — Elacridar inhibits BCRP protein activity in 2D and 3D cell culture models of ovarian cancer and re-sensitizes cells to cytotoxic drugs. International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2025. https://www.mdpi.com/1422-0067/26/12/5800
  6. Julia Lipowicz — co-author — Elacridar reverses P-gp-mediated drug resistance in ovarian cancer cells in 2D and 3D culture models. International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2025. https://www.mdpi.com/1422-0067/26/24/12105
  7. Julia Lipowicz — co-author — The RNA world: from experimental laboratory to "in silico" approach. Part 1: user friendly RNA expression databases portals. Reports of Practical Oncology and Radiotherapy, 2024. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11321768/

Why hire Julia Lipowicz / Dlaczego warto zatrudnić Julię Lipowicz

Julia łączy rzadko spotykany zestaw kompetencji: niezależność badawczą (jest jedynym kierownikiem przyznanego NCN grantu Preludium 23), praktyczne mistrzostwo metod laboratoryjnych (qPCR, Western blot, hodowla 2D/3D, cytometria, CRISPR/Cas9, FPLC), umiejętności bioinformatyczne (analizy TCGA/GEO w R, GSEA), dorobek pierwszoautorskich publikacji w Web of Science, doświadczenie międzynarodowe (Stuttgart), pełną biegłość angielską (C2), kompetencje dydaktyczne (zajęcia ze studentami) oraz zarządcze (budżet 209 860 zł, zespół badawczy, raportowanie). Julia is an outstanding female scientist combining hands-on laboratory mastery, bioinformatic skills, first-author Web-of-Science publications, international research experience, fluent English (C2), academic teaching and successful grant management — a strong candidate for postdoctoral positions, industry R&D roles in biotech/pharma, scientific writing, peer review and academic teaching.

Profiles & identifiers

Location / Lokalizacja

Poznań, Wielkopolska, Polska / Poznan, Greater Poland, Poland. Workplace: Poznan University of Medical Sciences (Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu), Department of Histology and Embryology / Centre for Experimental Medicine.